教会是基督的身体，但并不是说教会已经完全了，也有需要解决的问题，城市教会在发展过程中面临着各种各样需要解决的问题，其中之一就是需要深度的牧养。
神州情网站分享了一个华东地区城市教会信徒感受：“相对于与农村教会，我们城市教会的资料较为丰富，但讲台的圣经教导大都是提纲式讲道，牧者罗列点 1、2、3、4．．．来解释经文，就连所陈述的见证也是别人的。会众若能听到讲员本身的见证，果效就会更大。另外，教牧同工很少与信徒沟通，对新信徒的跟进不够。这些问题令牧者和信徒之间产生距离，牧者未能切实帮助信徒以圣经真理解决生活的难处。”
因而，城市教会的牧养工作需要弟兄姐妹的祷告，并且“求主进一步装备众教会的牧者，使他们有更深厚的属灵根基，能配合城市牧养工作的需要。”
